依照国家计委与国家质量技术监督局[2003]312 号文件规定的《质量体系认证收费标准》、国家计委与国家环保总局《关于环境管理体系认证收费的通知》（计价格[1999]1556号文的规定）以及国家认监委2010年第5号公告《食品安全管理体系认证实施规则》（CNCA-N-007：2010），质量管理体系、环境管理体系、职业健康安全管理体系的审核费用项目与金额基本相同，食品安全管理体系认证费用参照质量管理体系认证费用，即可分为固定费用、审核费用和变动费用。固定费用包括认证申请费、注册费、标志使用费；审核费是审核时间（人天数）与人日费的乘积，审核时间见上节，国内证书人日费的标准为3000元/人–日，国外证书人日费未作规定（实际情况是比国内证书费用高许多）；变动费用包括两个部分，其一是按照惯例支付的审核员在进行初访（第一阶段审核）、审核时发生的实际食宿、交通费用，其二是不可遇见的由于组织原因导致额外的审核时间及费用，如对第一阶段审核发现的重大需要改进项目的在第二阶段审核实施前的现场验证等。
以上信息汇总成以下管理体系各阶段认证费用一览表。表中数据为以上规章规定的要求，为国内认证机构认证收费的参照依据，国内境外认证机构认证审核（取得国外认可标志认证证书，认证标准为ISO或OHSAS，非GB/T）费用标准一般比此标准要高一些，具体可与认证机构商议。
由于国内认证行业的无序竞争，以及僧多粥少的市场现状，一些认证机构采购降低认证费用的方式吸引认证客户，造成了诸多负面影响，为此中国认证认可协会（CCAA）于2007年发布了《认证机构公平竞争规范——管理体系认证价格暂行规定》（2009年修订），对质量、环境和职业健康安全管理体系各阶段认证审核费用做出了最低限价要求（不含审核员交通、食宿费用），此规定对CCAA的认证机构会员有约束力。
该规定对质量管理体系认真审核的最低限价的规定如下：
——员工人数在65人以下，初审最低限价为12000元；
　　——员工人数在66－125人，初审最低限价为18000元；
　　——员工人数在126－275人，初审最低限价为21000元；
　　——员工人数在276－625人，初审最低限价为28000元；
    ——员工人数在626－1175人，初审最低限价为32000元；
　　——员工人数在1176－1550人，初审最低限价为36000元；
    ——员工人数在1551－2000人，初审最低限价为40000元；
　　——员工人数在2001人以上时，每增加一个审核人日，认证收费最少增加2400元。
此规定中的第四条“两体系结合审核初审的最低限价为相应的两个单体系初审最低限价之和的75%；三体系结合审核初审的最低限价为相应的三个单体系初审最低限价之和的65%。”此规定应该可以作为各体系整合后的审核乃至四大体系一体化结合审核时审核费用的确定依据。
该规定中的第五条“再认证的最低限价为相应初审最低限价的2/3，监督审核的最低限价为相应初审最低限价的1/3。
关于组织建立包括质量管理体系在内的管理体系咨询费用，国际惯例为管理体系（初次）认证审核费用的2－3倍。
注：不过，该规定中还有处罚规定，CCAA这个行业协会处罚权的授权来自哪里呢?让人觉得不可思议!
包括质量管理体系在内的各管理体系认证费用计算可参照下表形式来进行。
表7－4管理体系认证审核费用一览表 

类别	初次认证审核费用	监督审核费用	三年后再认证审核费用
固定 费用	5000元，其中： 申请费1000元； 审定与注册费2000元； 年金(含标志使用费)2000元 认可标志使用费1000元	年金(含标志使用费)2000元	同初次认证审核费用 按惯例可免申请费
审核 费用	审核时间（人日数）×人日费 人日费：3000元/人–日
变动 费用	—如需加印证书，每证另收费50元 —由于组织原因导致的额外审核时间 —审核员的交通、食宿费用	审核员的交通、食宿费用	—如需加印证书，每证另收费50元 —由于组织原因导致的额外审核时间 —审核员的交通、食宿费用

    注1：对于组织而言，变动费用可在认证合同中以固定数量加以包干。
注2：取得境外认证机构的境外授信（认可）标志的认证要比此表中各项费用数目高一些，特别是人日费。